在探讨离婚冷静期期间分居是否合法之前，我们先来了解一下相关的法律规定和实际案例，以便更好地理解这个问题。
法律规定
根据《中华人民共和国婚姻法》第三十二条规定，夫妻双方可以协议离婚，但应当经过三十日的冷静期。在这三十日的冷静期内，任何一方都可以向人民法院撤回离婚申请。
关于分居，婚姻法并没有明确规定在离婚冷静期内是否可以分居。但根据司法实践，以下情况下的分居是合法的：
双方自愿分居：如果夫妻双方在冷静期内达成一致意见，决定分居，并且这种分居是为了维护双方或子女的利益，那么这种分居是合法的。
为了维护家庭和谐：在某些情况下，分居可能是为了给双方一个冷静思考的机会，避免冲动离婚。这种情况下，分居也是合法的。
为了保护自己的人身安全：如果一方在婚姻中遭受家庭暴力，为了保护自己的人身安全，可以与对方分居。
实际案例
以下是一些实际案例，可以帮助我们更好地理解离婚冷静期期间分居的合法性：
案例一：夫妻双方在冷静期内达成一致意见，决定分居。在这种情况下，分居是合法的。
案例二：一方在婚姻中遭受家庭暴力，为了保护自己的人身安全，与对方分居。这种情况下，分居也是合法的。
案例三：夫妻双方在冷静期内没有达成一致意见，一方要求分居。在这种情况下，分居可能不合法，因为双方尚未度过冷静期。
总结
离婚冷静期期间，分居是否合法，关键在于夫妻双方是否自愿分居，以及分居的原因。只要分居是为了维护双方或子女的利益，或者是为了保护自己的人身安全，那么分居就是合法的。在实际操作中，建议夫妻双方在冷静期内保持沟通，共同解决问题，避免冲动离婚。